2005年3月教育部下发了《教育部关于同意建立烟台南山学院的通知》（教发函[2005]24号），批准学校实施本科教育为主，同时可举办专科层次的高等职业教育。烟台南山学院成为山东省首批民办本科院校。

　　2005年学校招收新生8000人，全日制在校生达18000余人。

　　2005年7月东海新校区第一期20万平米的建设项目落成，包括部分基础教学楼、院系楼、饮食广场、学生公寓等。2005年8月工商管理学院、外国语学院、艺术学院、经济贸易学院、信息管理学院等5个二级学院的80多名学生入住新校区。

　　2005年，是烟台南山学院最为值得铭记的一年。一所本科院校傲然屹立于胶东半岛，改写了胶东半岛乃至于山东省高等教育办学格局，开启了山东省民办教育历史新的一页。

　　2006年，学校包括图书馆、基础教学楼、行政中心、学生公寓、教工宿舍、饮食广场、体育场、实验技术中心总建筑面积2万平方米的二期基建工程已经全面展开。人文化、智能化的现代大学新城，将展现在胶东大地。

　　2008年，学校整体建筑都已建设完毕，学校现有三个学习生活区。

　　2010年1月，在由搜狐网、搜狐教育频道主办的“60年，见证教育大国崛起” 2009中国教育总评榜暨60年教育成就奖评选活动中，我校获评“建国60年中国教育百强品牌”，郝宪孝院长被评为“中国教育60年60人”。

　　2010年5月，在山东省“十佳求学高校”评选中获得第一名。