解放军南京政治学院隶属总政治部领导，是全军研究生培养单位重点建设院校。学院由院本部(南京院区)和上海分院(上海院区)组成,面向全国全军招生，主要培养全军政治指挥军官、政治机关干部、政治理论和政治工作教研人员、军事新闻宣传干部、军事信息管理干部。

学院从1987年开始进行研究生教育，1990年获得硕士学位授予权，1995年被总部确定为全军研究生培养单位重点建设院校，1996年被总政评为全军政治理论教学先进院校，2000年被国务院学位委员会批准为博士学位授予单位，2001年招收项目博士后，2003年获准设立博士后科研流动站。

学院目前设有政治学、军队政治工作学两个博士后科研流动站，拥有马克思主义理论与思想政治教育、军队政治工作学、马克思主义哲学、军事历史、图书馆学等5个博士学位授权点，拥有马克思主义哲学、伦理学、政治经济学、政治学理论、科学社会主义与国际共产主义运动、中共党史、马克思主义理论与思想政治教育、应用心理学（军事心理学）、新闻学、传播学、军事思想、军事历史、军队政治工作学、图书馆学、情报学、档案学等16个硕士学位授权点。马克思主义理论教育、军政政治工作（含军事新闻）和军事心理学为全军院校“2110工程”重点建设学科专业领域点。