上海船舶运输科学研究所成立于1962年，位于上海市浦东新区陆家嘴功能区地块；原为交通部直属科研事业机构，2000年转制为中央科技型企业，改由中央企业工作委员会领导；2003年划归国务院国有资产监督管理委员会管理。截至2008年底，本所资产总额为7.57亿元人民币；占地面积130余亩。

本所现有从业人员近800人，其中80%以上为科技人员，具有高级专业技术职称的人员达190余名。经国务院学位委员会批准，本所现设有四个硕士研究生培养点（通信与信息系统、交通信息工程及控制、船舶与海洋结构物设计制造、轮机工程）。

作为国家最大的交通运输综合技术研究开发基地，本所拥有船舶运输控制系统国家工程中心和航运技术交通行业重点实验室。本所专业特色突出、技术力量雄厚、试验设施先进，长期从事交通运输行业共性技术、前瞻性技术的开发研究。本所在舰船自动化、智能交通、环境工程以及船舶水动力业务领域处于国内领先水平。

目前研究开发和生产经营领域包括：舰船自动化设备研制、智能交通系统机电工程、环境影响评价及 污染防治工程、船舶水动力及海事技术试验研究等；开展主营领域新技术、新装备和系统集成的论证、开发、设计、生产以及工程承包、技术咨询等业务。

建所以来，共取得重大科技研究成果1000多项，其中获得国家、交通部和上海市科技进步奖、发明奖和优秀新产品奖300多项。改革开放以来，本所坚持“两个文明”一起抓，发扬“团结、求实、创新、奉献”的船研精神，先后获得全国“五一”劳动奖状先进集体、交通部两个文明建设先进单位、全国交通系统先进科研单位、上海市“红旗集体”等荣誉称号，1991年以来连续十次被评为“上海市文明单位”。

未来一个较长时期，我国交通运输业、造船行业、环保业和国防建设的快速发展将为本所的发展提供巨大的需求动力，成为本所发展的重要战略机遇期。本所的战略目标是：

成为中国最著名的舰船自动化与智能交通系统集成研发制造商、国内一流的舰船水动力试验研究与环境工程服务商。

本所在努力实现战略目标的同时，愿为提高我国交通运输业、造船业和环保业的技术水平、装备水平、管理水平以及国防建设发展作出积极贡献。