中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所（简称渔机所）于1963年5月在上海成立，定名为“中华人民共和国水产部渔业机械仪器研究所”；1970年和1978年先后易名为“上海市渔业机械仪器研究所”和“国家水产总局渔业机械仪器研究所”；1982年更改为现名，归属农业部。

渔机所是我国唯一的在渔业装备与工程应用基础和集成创新方面开展综合研究与科技攻关的研究机构，其研究范围几乎涵盖了渔业装备研究领域的各个方面。建所以来，承担了我国渔业装备领域大量具有全局性、关键性意义的重大科研任务，先后取得了包括叶轮式增氧机、半导体探鱼仪、颗粒饲料加工机组、中高压液压起网设备、围网渔船、织网机、GPS导航仪及高海况打捞设备等170多项科研成果，其中70多项次获得了国家或省部级科学技术进步奖；完成论文、学术报告700余篇。建所40多年所取得的科研成就，为推进我国的渔业生产力的发展发挥了重要作用。

渔机所现有职工167人，其中科技人员111人（高级专业技术人员37人）；全所总占地面积3.6公顷（含松江实验中试基地），房屋建筑面积21305平方米，拥有各类仪器设备900多台（套）。

渔机所的主要研究领域为水产养殖工程、海洋渔业工程、水产品加工机械、船舶工程、饲料加工机械工程等；所内设有养殖工程、海洋渔业工程、加工机械工程、渔业装备信息等四个研究室，以及农业部渔业装备与工程重点开放实验室、中国水产科学研究院渔业水体净化技术和系统研究重点开放实验室、海洋渔业装备性能研究实验室、加工机械系统功能实验室、检测实验室和松江渔业装备实验中试基地等；国家渔业机械仪器质量监督检测中心、农业部环保机械设备及船用产品质量监督检验测试中心和农业部渔业局渔业机械仪器标准化技术归口办公室等机构均挂靠在渔机所；编辑出版中文核心期刊《渔业现代化》（原名《渔业机械仪器》）。

渔机所的发展定位是成为国家渔业装备与工程技术研发中心。

2005-2006年度和2007-2008年度，渔机所被评为上海市精神文明单位。