清华长三角研究院是2003年12月31日由浙江省人民政府与清华大学本着优势互补、共同发展的精神联合组建的机构，是浙江省正厅级事业单位。研究院的宗旨和目标为：以清华大学的科研、技术、人才为依托，立足浙江省，面向长三角地区经济社会发展需求，在先进制造、信息技术、生物医药、生态环境保护、海洋资源开发等领域，设立重点实验室、工程研究中心，建立国际技术转移中心和继续教育基地，努力将研究院建成为国内一流的科技创新、人才培训和高新技术产业化基地，促进浙江省及长三角地区科技、经济与社会及清华大学教育、科技事业的全面发展。 研究院总部位于嘉兴市南湖区嘉兴科技城，在嘉善县、平湖市分设院区。

   在近两年里，研究院在基础设施、机构设置、科研基地、人才队伍等建设方面已基本完善。研究院的发展目标是，到2013年成为国内一流的科技创新、人才培养和高新技术产业化基地。